Amplikonové sekvenování s dlouhým čtením (Long-Read Amplicon Sequencing) je technika sekvenování DNA, která kombinuje amplifikaci cílové oblasti a dlouhá čtení (long-read) jednotlivých molekul DNA. Amplikonové sekvenování se používá k sekvenování specifických oblastí genomu (tzv. ampliconů), které jsou zájmové pro daný experiment.

Dlouhá čtení umožňují překonání rozsah krátkých čtení, která jsou při sekvenování DNA používanější. Dlouhé čtení poskytuje podrobnější informace o struktuře genomu, jako jsou například přítomnost a délka repetitivních sekvencí, genových fúzí a inverzí. Také umožňuje lepší rozlišení alel a haplotypů. Na rozdíl od technologií krátkého čtení, nevyžadují dlouhá čtení sekvenování SMRT fragmentaci amplikonu a umožňují fázování variant napříč celým amplikonem.

Amplikonové sekvenování s dlouhým čtením

Spolehlivá pomoc s genetickými výzkumy

Využijte náš ultra-hluboký a nepřetržitý amplikonový sekvenační servis, který dokáže zpracovat sekvenace až o délce 10 000 bp. Pouze s jedním čtením PacBio® můžeme odhalit širokou škálu variant, od SNP a malých indelů až po velké inzerce a delece. Navíc, naše metoda generuje kruhové konsenzuální sekvence pro zajištění volání jedné molekuly s až 99,999% přesností. Budeme rádi, když vám pomůžeme s vašimi genetickými výzkumy.

pracovní postup amplikonového sekvenování s dlouhým čtením
Znázornění pracovního postupu amplikonového sekvenování s dlouhým čtením

Jaké využití má amplikonové sekvenování s dlouhým čtením:

  • snadná identifikace velké indels a strukturální varianty zprostředkované CRISPR
  • fázování alel a variant napříč celým genem
  • typizace HLA v plné délce
  • sekvenování genů 16S, 18S a ITS v plné délce
  • párové sekvenování fágů s těžkým a lehkým řetězem
  • sekvenovaní amplikonů na zakázku

Pokyny pro zaslání vzorků a doručení dat

Pro amplifikované sekvenování přijímáme širokou škálu vzorků, včetně purifikovaných a nepurifikovaných amplikonů, restrikčně štěpeného materiálu a plazmidů. Kromě toho máme schopnosti připravit amplikony z různých výchozích materiálů, jako je genomová DNA, buněčné pelety a tkáňový materiál. Naše služby jsou flexibilní a přizpůsobíme se vašim individuálním potřebám. Výstupy projektu zahrnují souhrnnou zprávu o datech, nezpracované datové soubory ve formátu BAM a demultiplexní CCS čtení ve formátu FASTQ.

ANCHOR_TOP_TITLE

Tento web využívá cookies

Pro chod webu jsou nezbytně aktivovány esenciální soubory cookies. Pro plnohodnotné poskytování služeb, personalizaci reklam a analýzu návštěvnosti jsou však nutné povolit i volitelné cookies. Kliknutím na následující tlačítko, je zapnete. Zobrazit podrobnosti

Nastavení cookies

Vaše soukromí je důležité. Můžete si vybrat z nastavení cookies níže. Zobrazit podrobnosti