Eukaryotní TruSeq RNA-Seq (Transkriptom)

1. Katalogová čísla:

  • RA-105: Eukaryotní TruSeq RNA-Seq (Transkriptom)
  • SP-201-1104: Konstrukce TruSeqRNA-Seq knihovny
  • HS-102-1002: 91 PE sekvenování
  • BA-101-1101: Standardní bioinformatická analýza

2. Účel a význam:

Na základě sekvenční technologie příští generace, RNA-Seq (Transkriptom) je schopné podávat objektivní informace o transkriptomu a může být použito v různých vědeckých oblastech. Nicméně, běžné RNA-Seq (Transkriptom) vyžaduje více než 5 ug celkové RNA pro konstrukci jedné knihovny, což může být překážkou při uplatněnívzorků, jejichž množství se pohybuje na úrovni nanogramů. TruSeq RNASeq (Transkriptom) zpracovává vzorky pomocí IlluminaTruSeq RNA Sample Prep Kitu a může snížit požadované množstvícelkové RNA až na 200 ng, a tak výrazně rozšíři toblasti aplikace RNA-Seq.

3. Experimentální postup a metody

Experimentální postup a metody

4. Požadavky na vzorky

Stav vzorku Integrovaná celková RNA, která byla ošetřena DNázou. Vyhněte se kontaminaci proteiny při izolaci RNA.
Množství vzorku Pro konstrukci 1 knihovny - Pro člověka, krysy a myši: celková RNA≥200ng; U ostatních vzorků: celková RNA≥1 ug;
Koncentrace vzorku Pro člověka, krysy a myši: koncentrace≥5ng/ul; pro ostatní vzorky: ≥20ng/ul
Čistota vzorku 28S:18S > 1.0; pro živočichy RIN ≥ 7.0, pro rostliny RIN≥ 6.5; OD260/280 ≥1.8; OD260/230 ≥ 1.8
Strategie konstrukce knihovny

Knihovna krátkých insertů: cca 160 bp krátké inserty (bez purifikace z gelu)

Sekvenční strategie 91 PE Sekvenování
Obsah bioinformatické analýzy Obsah analýzy je stejný jako u Eukaryotní RNA-Seq (Transkriptom).
Ukazatel dokončení Čistá výstupní data by neměla být menší, než je požadováno ve smlouvě.
Doba zpracování Standardní doba odezvy pro tento postup (viz výše) je 50 pracovních dní (více dnů bude uvedeno při 20 a více vzorků).

Chcete spolupracovat s BIOGEN Praha? Napište nám

Položky označené hvězdičkou (*) jsou povinné.



Zasílání novinek e-mailem

Zadejte Váš e-mail a nechte si zasílat novinky a zajímavé informace do vaší e-mailové schránky.

Zasílání novinek e-mailem

Rychlý kontakt

BIOGEN PRAHA s.r.o.
Ke sv. Izidoru 2293/4A
140 00 PRAHA 4

Tel.: +420 241 401 693
E-mail:

>> Kontakty společnosti
>> Kontakty na biobary

© 2017, BIOGEN PRAHA s.r.o. – všechna práva vyhrazena

Prohlášení o přístupnosti | Podmínky užití | Ochrana osobních údajů | Mapa stránek

Webové stránky vytvořila eBRÁNA s.r.o. | Vytvořeno na CMS WebArchitect | SEO a internetový marketing

Nahoru ↑